Durante una sparatoria e un inseguimento, Dixon viene ferito
da Vaughn! 48 ore prima Sloane convoca Sydney le dice di aver scoperto che ha
ricevuto un sms da Vaughn e che gli da 48 ore per contattarli prima di notificare
la cosa a Langley. Nadia riceve una telefonata dalla zia Katya Derevko e va a
trovarla in prigione per sapere qualcosa su Irina. Nel frattempo a Parigi Vaughn
incontra Roberts da cui riceve delle informazioni riguardo suo padre
promettendogli "la serpentina" che serve ad attivare un congegno creato da
Rambaldi. Gli vengono mostrate delle foto che attestano che il padre Bill è
ancora in vita ma per proseguire nelle ricerche ed avere altre notizie è
costretto ad aiutarli a recuperare un prezioso manoscritto. Più tardi, Nadia dice a Sydney della sua visita
alla zia che ora è ricoverata all'ospedale per una reazione allergica. Sydney
per mettere in guardia Nadia le rivela che la madre aveva assoldato un killer
per ucciderla, poi va da Katya per dirle di lasciare in pace Nadia. Katya le dice che Irina
non avrebbe mai voluto ferirla e le confida che Irina voleva vendicarsi perché era risalita a colui che
realmente aveva pagato il killer. Sydney su informazioni di Katya, recupera un
carillon e scopre un codice che porta al numero di un conto in banca registrato sotto il nome di “A. Sloane”
e dimostrerebbe che proprio lui la voleva morta. Sydney ritorna da Katya e le dice che Nadia non dovrà mai saperlo.
All’APO Marshall segretamente fa un test a Jack per scoprire se ci sono effetti
dell’esposizione alle radiazioni dovute alla missione usignolo; i risultati
mostrano una mutazione genetica in corso su larga scala, e Marshall dice a Jack
di vedere un dottore immediatamente. Vaughn nel frattempo con una partner del
gruppo, si intrufola in un ospedale come un marito con la moglie ferita, e poi
come dottore e infermiera, riuscendo a rubare un
laser che servirà al furto del manoscritto. Vaughn organizza un piano per fare
l'assalto al furgone che lo trasporta. Vaughn non lo sa ma la supervisione del
trasporto del manoscritto di Rambaldi è affidata a Dixon. Il gruppo parte e
subito Vaughn con la sua partner ad un semaforo, utilizzando il laser rubato, si
intrufola nel furgone; successivamente, il furgone viene bloccato e inizia una
sparatoria. durante la fuga alcuni membri della banda vengono feriti e
anche Dixon viene colpito proprio da
Vaughn (ma volutamente nel giubbotto antiproiettile). Vaughn rientra con il
manoscritto e attacca Roberts, lo picchia finché non gli rivela che il padre di
Vaughn è morto davvero nel 1979 e che tutte le prove sono state create apposta.
Vaughn chiede a Roberts per chi lavora, e lui risponde che lavora per Sloane.
Rientrato a Los Angeles, Vaughn racconta a Sydney che il padre è morto nel 1979
dice che suo padre non avrebbe mai abbandonato la gente che ama e lo sa perchè
lui è come suo padre. Le dice inoltre che alla base dell’inganno c'è Sloane, e che che lo
ucciderà. Successivamente a Santiago in Cile, un uomo va da “Mr. Sloane” e gli dice che non hanno il
recuperato il manoscritto. Mr. Sloane replica che niente è cambiato, e che procederanno come
pianificato. Questo Signor Sloane somiglia molto al direttore dell'APO, ma non è
lui.
