Sydney, Irina, Jack, Vaughn e Nadia atterrano con i
loro paracaduti a Mosca. Lo scenario che gli
si presenta davanti è raccapricciante. Mentre stanno perlustrando il
territorio trovano per trovare la loro squadra di supporto incontrano Brodien,
l'agente della CIA, unico sopravvissuto all'attacco di tutti gli uomini
avvelenati da Elena Derevko. Brodien
gli rivela che la sua squadra è stata uccisa dalle persone che hanno
bevuto l'acqua infetta, spiega che queste persone infette
appena vedono qualcuno lo aggrediscono e lo uccidono. Intanto insieme
organizzano un piano per arrivare al congegno che si trova oltre la
metropolitana Quando viene aperto l'ingresso della metropolitana, un
uomo infetto uccide Brodien.
Sloane ed Elena sanno che stanno per arrivare gli agenti dell'APO
insieme ad Irina per disattivare il congegno. Sydney e Nadia sono
arrivate alla sala di controllo e per far funzionare la metropolitana
devono sbloccare i comandi manualmente. Marshall e Weiss riescono a
scoprire, sempre grazie all'indice Blackwell, del materiale per
ricattare il Ministro russo e farsi dare un codice che gli serve per poter accedere
ad alcuni dati della rete Sovietica. Irina e Jack vedono un cavallo color rosso sangue e
Irina dice a Jack che nella profezia di Rambaldi quando si vedranno
cavalli color rosso sangue e cadranno angeli dal cielo la prescelta
(Sydney) e il passeggero (Nadia) si scontreranno e solo una di loro
vivrà. Mentre Sydney, Irina, Jack e Vaughn salgono sulla metro, Nadia
sblocca i comandi ma viene assalita dalle persone infette, Sydney prova
a salvarla ma senza risultati. La metro arriva vicino all'edifico in cui
si trova il congegno, Irina tranquillizza tutti dicendo che Nadia è
ancora viva anche se non sa come. Dopo si sentono degli spari così viene
fermata la metro, tutti scendono e vedono che Sloane ha ucciso alcuni
dei suoi uomini, mandati da Elena per fermare la squadra.
Intanto Nadia riesce a salvarsi ed esce dalla stazione. Uscita dalla
stazione vede una statua di un angelo, e soccorre un uomo che chiede
aiuto! purtroppo è una trappola ed Elena la cattura. Nadia non vuole
unirsi a sua zia, così Elena le inietta dell’acqua infetta rendendola violenta. Sydney va sul tetto dell'edifico dove si trova
il pannello di controllo del congegno per disattivarlo.
Irina con Jack e Vaughn, catturano Elena e la costringono a confessare qual
è il filo da tagliare per disattivare il congegno. All'improvviso arriva
anche Nadia sul tetto e si
scatena contro Sydney. Sydney dopo il combattimento riesce ad
immobilizzarla legandola ad una catena. Irina riesce a farsi dire dalla sorella qual è
il filo da tagliare e la uccide. Mentre Sydney sta per tagliare il filo,
Nadia riesce a liberarsi e cerca di aggredire nuovamente la sorella, ma
Sloane arriva e colpisce Nadia alle spalle, salvando così Sydney, Vaughn arrivato sul tetto aiuta
Sydney.
Dopo che Sydney taglia il filo avranno quindici secondi per mettersi
in salvo. La squadra riesce a disattivare il congegno e a mettersi in
salvo dalla massa di acqua che gli cade sulla testa dovuta allo
scioglimento della sfera che sovrastava la città. A fine missione Jack fa scappare Irina per non farle scontare
la pena in prigione. Rientrati a Los Angeles finalmente Sydney e Vaughn
riescono a fare il viaggio verso Santa Barbara. Sono in macchina e parlano delle
loro nozze, Vaughn confessa che non è stato un caso che si siano
incontrati e che il suo vero nome non è Michael Vaughn. Dall'altra parte
della strada arriva un camion e vengono coinvolti in un incidente.
